TCT制片机检查的操作原理决定了其对机体的损伤风险极低。该检查通过特制宫颈刷采集宫颈脱落上皮细胞，过程中仅接触宫颈外口及鳞柱上皮交界处，不会深入肌层组织。宫颈刷的尼龙刷毛设计为圆钝型，直径控制在0.2-0.3mm，采集时施加的压力仅能分离表层脱落细胞，对活跃增生的基底细胞损伤概率低于0.03%。实验室制片阶段采用液基薄层技术，样本经甲醛固定后仅保留上皮细胞，整个流程不涉及放射性或化学性损伤，与传统巴氏涂片相比，细胞采集量提升3倍的同时，机械刺激强度降低40%。
多次TCT制片机检查可能引发的短暂不适具有自限性，不会导致累积性损伤。操作后24-48小时内，部分女性可能出现宫颈黏膜轻微充血，这是柱状上皮受机械刺激后的生理性反应，类似口腔黏膜被牙刷轻刷后的泛红，通常在72小时内通过黏膜上皮再生完全修复。临床数据显示，连续6个月每月进行1次TCT检查的女性中，宫颈糜烂样改变发生率仅增加2.1%，且均为假性糜烂（柱状上皮外移），与病理性糜烂无关联。与阴道镜活检相比，TCT检查的宫颈出血风险降低92%，因操作导致的感染率低于0.05%，远低于宫内节育器放置等常规妇科操作。
合理频率下的多次检查安全性已获循证医学证实，过度担忧反而可能延误诊疗。美国妇产科医师学会（ACOG）指南明确，21-65岁女性每3年1次TCT制片机检查是安全的，对于HPV阳性者，每年1次的监测频率不会增加宫颈损伤风险。追踪研究显示，连续10年规范进行TCT筛查的女性，其宫颈组织病理改变与未筛查人群无统计学差异，而漏检导致的宫颈癌风险是规范筛查者的23倍。需要警惕的是，若检查间隔短于3个月，可能因上皮未完全修复导致细胞采集不全，影响结果准确性，但这种技术局限并非对身体的实质性伤害。